北京种子协会2004年经北京市民政局批准成立，主要是由从事农作物、畜禽、水产、林果花草等种业资源保护、品种选育、生产、加工、检测、经营、储运及相关服务的企业、科研机构、事业单位和社会团体，自愿组成的全市性、行业性、非营利性社会组织，接受北京市农业农村局业务指导和北京市民政局监督管理。2017年底依法与行政管理部门人、财、物和办公场所彻底脱钩，成为民主管理、自我约束、协同发展的行业社团。2018年1月被评为：“4A级中国社会组织”，2019年成为北京市民政局“北京市行业协会商会信用体系建设试点单位”、荣获农业农村部“全国农业植物新品种保护先进集体”称号；2020年6月更名为“北京种业协会”。

协会以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入学习贯彻党的二十大精神，全面落实习近平总书记关于种业振兴重要指示批示精神，认真贯彻落实《中华人民共和国种子法》、《北京市种子条例》、《北京种业振兴实施方案》。协会坚持“立足北京、协同津冀、服务全国、走向世界”的发展思路，围绕打造北京“种业之都”、建设全国种业新发展高地、营造种业创新发展环境、促进种业行业交流交易、丰富首都人民美好生活等方面开展具体工作。协会本着为政府、为行业、为会员、为用种者服务的原则，在组织专题调研、开展种业发展研讨、技术培训、搭建新产品新技术交流平台，特别是在倡导诚信经营、将会员及其优异产品推向全国，以及维护会员和行业合法权益等方面做了大量工作，是政府联系北京种业的桥梁和纽带，为推动全行业的健康发展做出贡献。

为推进形成高质量党建引领协会发展的新机制，推进协会党建工作从“有形覆盖”转向“有效覆盖”。2021年12月中共北京市商业服务业行业协会第五联合委员会批复同意成立北京种业协会流动党支部。自支部成立以来，坚持党的领导，加强党的建设，北京种业协会流动党支部聚焦新时代党建工作新特点新任务新要求，将党建工作同业务有机结合，以高度的责任感、使命感，积极的主动性、创造性，引导协会传递正能量，充分彰显党建工作价值创造力。

协会积极寻求与社会各界交流合作，建立适应新时代种业经济发展特征的新型服务体系，打造政府、会员、种业用户，以及其他相关单位互联互通的实用平台，为不断提升农牧渔业生产能力和城乡人民生活水平贡献更大力量。